- absi()
: emdata_core.h
- active_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- add()
: emdata_core.h
- add_complex_at()
: emdata_core.h
- add_complex_at_fast()
: emdata_core.h
- add_img()
: util_sparx.h
- add_img2()
: util_sparx.h
- add_img_abs()
: util_sparx.h
- addn_img()
: util_sparx.h
- addnod_()
: util_sparx.cpp
- addsquare()
: emdata_core.h
- ali2d_ccf_list()
: util_sparx.h
- ali3d_d()
: ali3d_d_mpi.h, ali3d_d_mpi.cpp
- align()
: emdata_modular.h
- alphaxpy()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- alprbs()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- alrl_ms()
: util_sparx.h
- alrq()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- alrq_ms()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- amplitude()
: emdata_core.h
- ang_diff()
: util_sparx.h
- ang_n()
: spidutil.h, spidutil.cpp, util_sparx.h
- ang_to_xyz()
: util_sparx.h
- angle_()
: util_sparx.cpp
- ap2ri()
: emdata_transform.h
- apmaster_1()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- apmd()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- apmq()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- append_image()
: emdata_io.h
- Applyws()
: util_sparx.h, ali3d_d_mpi.h, ali3d_d_mpi.cpp
- applyws()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- apring1()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- aprings()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- aprq2d()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- areas_()
: util_sparx.cpp
- areav_()
: util_sparx.h
- areav_new__()
: util_sparx.cpp
- array_mutation()
: util_sparx.h
- assign_groups()
: util_sparx.h
- assign_projangles()
: util_sparx.h
- asta2()
: utilnum.h, utilnum.cpp, utilcomm.h
- autocorrelation()
: fundamentals.h
- average_circ_sub()
: emdata_sparx.h
- calc_bessel()
: emdata_transform.cpp
- calc_ccf_cuda()
: cuda_processor.h
- calc_center_density()
: emdata_metadata.h
- calc_center_of_mass()
: emdata_metadata.h
- calc_conv_cuda()
: cuda_processor.h
- calc_fourier_shell_correlation()
: emdata_sparx.h
- calc_fourier_shell_correlation_cuda()
: cuda_cmp.h
- calc_highest_locations()
: emdata_metadata.h
- calc_max_index()
: emdata_metadata.h
- calc_max_location()
: emdata_metadata.h
- calc_max_location_wrap()
: emdata_metadata.h
- calc_max_location_wrap_cuda()
: cuda_processor.h
- calc_max_location_wrap_intp()
: emdata_metadata.h
- calc_max_location_wrap_intp_cuda()
: cuda_processor.h
- calc_min_index()
: emdata_metadata.h
- calc_min_location()
: emdata_metadata.h
- calc_n_highest_locations()
: emdata_metadata.h
- calc_sigma_diff()
: emdata_metadata.h
- calculate_ccf()
: cuda_ccf.h
- calculate_multiref_ccf()
: cuda_ccf.h
- call_cl1()
: util_sparx.h
- CANG()
: util_sparx.h
- cauchy_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- cb2sph()
: project3d.h, project3d.cpp
- ccc_cmp_cuda()
: cuda_cmp.h
- ccc_images()
: util_sparx.h
- ccc_images_G()
: util_sparx.h
- center_origin()
: emdata_sparx.h
- center_origin_fft()
: emdata_sparx.h
- center_origin_yz()
: emdata_sparx.h
- char_func()
: mympimodule.c
- checked_delete()
: reconstructor.cpp
- circle_()
: util_sparx.cpp
- circum_()
: util_sparx.cpp
- circumf()
: reconstructor.cpp
- circumf_rect()
: reconstructor.cpp
- circumference()
: emdata_sparx.cpp
- cl1()
: util_sparx.h
- CleanStack()
: utilcomm.h, utilcomm.cpp
- CleanStack_Cart()
: utilcomm_Cart.h, utilcomm_Cart.cpp
- clearupdate()
: emdata_metadata.h
- cluster_equalsize()
: util_sparx.h
- cluster_pairwise()
: util_sparx.h
- cm_euc()
: emdata_sparx.h
- cml_disc()
: util_sparx.h
- cml_init_rot()
: util_sparx.h
- cml_line_in3d()
: util_sparx.h
- cml_line_insino()
: util_sparx.h
- cml_line_insino_all()
: util_sparx.h
- cml_prepare_line()
: util_sparx.h
- cml_spin_psi()
: util_sparx.h
- cml_spin_psi_now()
: util_sparx.h
- cml_update_rot()
: util_sparx.h
- cml_weights()
: util_sparx.h
- cmp()
: emdata_modular.h
- cmp1()
: util_sparx.h
- cmp2()
: util_sparx.h
- cmp_axis_x()
: pointarray.cpp
- cmp_axis_y()
: pointarray.cpp
- cmp_axis_z()
: pointarray.cpp
- cmp_float()
: pointarray.cpp
- cmp_val()
: pointarray.cpp
- cmplx()
: emdata_core.h
- cmprlb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- cog()
: emdata_sparx.h
- colreverse()
: util_sparx.h
- column_orient()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- compcrit()
: varimax.cpp
- compose_transform2()
: util_sparx.cpp
- compress_image_mask()
: util_sparx.h
- conjg()
: emdata_sparx.h
- constrained_helix()
: util_sparx.h
- constrained_helix_test()
: util_sparx.h
- convolution()
: fundamentals.h
- copy()
: emdata_core.h
- copy_empty_head()
: emdata_sparx.h
- copy_head()
: emdata_core.h
- copy_matrix()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- copy_to_array()
: cuda_util.h
- copy_vector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- copywrite()
: mympimodule.c
- correlation()
: fundamentals.h
- coveig()
: util_sparx.h
- coveig_for_py()
: util_sparx.h
- covsph_()
: util_sparx.cpp
- crlist_()
: util_sparx.cpp
- Crosrng_e()
: util_sparx.h
- crosrng_e()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- Crosrng_ew()
: util_sparx.h
- Crosrng_ms()
: util_sparx.h
- crosrng_ms()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- Crosrng_ms_delta()
: util_sparx.h
- Crosrng_msg()
: util_sparx.h
- Crosrng_msg_m()
: util_sparx.h
- Crosrng_msg_s()
: util_sparx.h
- Crosrng_msg_vec()
: util_sparx.h
- Crosrng_msg_vec_p()
: util_sparx.h
- Crosrng_ns()
: util_sparx.h
- Crosrng_psi()
: util_sparx.h
- Crosrng_sm_psi()
: util_sparx.h
- cross()
: vecmath.h
- ctf2_rimg()
: util_sparx.h
- ctf_img()
: util_sparx.h
- ctf_rimg()
: util_sparx.h
- cuda_dd_fft_complex_to_real_nd()
: cuda_emfft.h
- cuda_dd_fft_real_to_complex_nd()
: cuda_emfft.h
- cuda_inittest()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_kmeans()
: cuda_kmeans.h
- cuda_mpi_dist()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_mpi_init()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_mpi_kmeans()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_mpi_kmeans_SA()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_mpi_shutdown()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cuda_readinit()
: cuda_mpi_kmeans.h
- cudasetup()
: cuda_ccf.h
- cutCheckBankAccess()
: cuda_defs.h
- cutCheckCmdLineFlag()
: cuda_defs.h
- cutCheckCondition()
: cuda_defs.h
- cutComparef()
: cuda_defs.h
- cutComparefe()
: cuda_defs.h
- cutComparei()
: cuda_defs.h
- cutCompareL2fe()
: cuda_defs.h
- cutCompareub()
: cuda_defs.h
- cutCompareube()
: cuda_defs.h
- cutCreateTimer()
: cuda_defs.h
- cutDeleteTimer()
: cuda_defs.h
- cutFindFilePath()
: cuda_defs.h
- cutFree()
: cuda_defs.h
- cutGetAverageTimerValue()
: cuda_defs.h
- cutGetCmdLineArgumentf()
: cuda_defs.h
- cutGetCmdLineArgumenti()
: cuda_defs.h
- cutGetCmdLineArgumentListstr()
: cuda_defs.h
- cutGetCmdLineArgumentstr()
: cuda_defs.h
- cutGetTimerValue()
: cuda_defs.h
- cutLoadPGMf()
: cuda_defs.h
- cutLoadPGMi()
: cuda_defs.h
- cutLoadPGMs()
: cuda_defs.h
- cutLoadPGMub()
: cuda_defs.h
- cutLoadPPM4ub()
: cuda_defs.h
- cutLoadPPMub()
: cuda_defs.h
- cutReadFileb()
: cuda_defs.h
- cutReadFiled()
: cuda_defs.h
- cutReadFilef()
: cuda_defs.h
- cutReadFilei()
: cuda_defs.h
- cutReadFileub()
: cuda_defs.h
- cutReadFileui()
: cuda_defs.h
- cutResetTimer()
: cuda_defs.h
- cutSavePGMf()
: cuda_defs.h
- cutSavePGMi()
: cuda_defs.h
- cutSavePGMs()
: cuda_defs.h
- cutSavePGMub()
: cuda_defs.h
- cutSavePPM4ub()
: cuda_defs.h
- cutSavePPMub()
: cuda_defs.h
- cutStartTimer()
: cuda_defs.h
- cutStopTimer()
: cuda_defs.h
- cutWriteFileb()
: cuda_defs.h
- cutWriteFiled()
: cuda_defs.h
- cutWriteFilef()
: cuda_defs.h
- cutWriteFilei()
: cuda_defs.h
- cutWriteFileub()
: cuda_defs.h
- cutWriteFileui()
: cuda_defs.h
- cyclicshift()
: util_sparx.h
- daxpy_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dcopy_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dcsrch_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dcstep_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- ddot_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- decimate()
: util_sparx.h
- del_attr()
: emdata_metadata.h
- del_attr_dict()
: emdata_metadata.h
- delarc_()
: util_sparx.cpp
- delete_disconnected_regions()
: emdata_sparx.h
- delnb_()
: util_sparx.cpp
- delnod_()
: util_sparx.cpp
- depad()
: emdata_sparx.h
- depad_corner()
: emdata_sparx.h
- Derivatives()
: steepest.h, steepest.cpp
- Derivatives_G()
: steepest.h, steepest.cpp
- determine_slice_agreement_cuda()
: cuda_reconstructor.h
- device_init()
: cuda_util.h
- disorder2()
: util_sparx.h
- dist()
: emdata_sparx.cpp
- dist_r()
: emdata_sparx.cpp
- div()
: emdata_core.h
- div_filter()
: util_sparx.h
- div_img()
: util_sparx.h
- divkbsinh()
: emdata_sparx.h
- divkbsinh_rect()
: emdata_sparx.h
- divn_filter()
: util_sparx.h
- divn_img()
: util_sparx.h
- dnrm2_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- do_cuda_fft_cache_destroy()
: cuda_emfft.h
- do_fft()
: emdata_transform.h
- do_fft_inplace()
: emdata_transform.h
- do_ift()
: emdata_transform.h
- do_ift_inplace()
: emdata_transform.h
- doRotation()
: varimax.cpp
- dot()
: vecmath.h, emdata_core.h
- dot_cmp_cuda()
: cuda_cmp.h
- downsample()
: emdata_sparx.h
- dpmeps_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dpofa_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- drand()
: lapackblas.h
- drwarc_()
: util_sparx.cpp
- dscal_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dtrsl_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- dump_aligners()
: aligner.h
- dump_aligners_list()
: aligner.h
- dump_analyzers()
: analyzer.h
- dump_analyzers_list()
: analyzer.h
- dump_averagers()
: averager.h
- dump_averagers_list()
: averager.h
- dump_cmps()
: cmp.h
- dump_cmps_list()
: cmp.h
- dump_factory()
: emobject.h
- dump_factory_list()
: emobject.h
- dump_orientgens()
: symmetry.h
- dump_orientgens_list()
: symmetry.h
- dump_processors()
: processor.h
- dump_processors_list()
: processor.h
- dump_projectors()
: projector.h
- dump_projectors_list()
: projector.h
- dump_reconstructors()
: reconstructor.h
- dump_reconstructors_list()
: reconstructor.h
- dump_symmetries()
: symmetry.h
- dump_symmetries_list()
: symmetry.h
- fcalc()
: fgcalc.h, fgcalc.cpp
- fft_shuffle()
: emdata_sparx.h
- fftc_d()
: spidfft.h, spidfft.cpp, util_sparx.h
- fftc_q()
: spidutil.h, spidfft.h, spidfft.cpp, util_sparx.h
- fftr_d()
: spidfft.h, spidfft.cpp, util_sparx.h
- fftr_q()
: spidutil.h, spidfft.h, spidfft.cpp, util_sparx.h
- fgcalc()
: fgcalc.h, fgcalc.cpp
- FH2F()
: emdata_sparx.h
- FH2Real()
: emdata_sparx.h
- fill_ones()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- fill_rand()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- fillveczeros()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- filt_dilation_()
: fundamentals.h
- filt_erosion_()
: fundamentals.h
- filt_median_()
: fundamentals.h
- filter_by_image()
: emdata_sparx.h
- filter_image()
: cuda_ccf.h
- find_3d_threshold()
: emdata_sparx.h
- find_group()
: util_sparx.cpp
- find_pixels_with_value()
: emdata_metadata.h
- find_region()
: emdata_metadata.cpp
- findomega()
: HyBR_Cart.h, HyBR_Cart.cpp
- flip23()
: util_sparx.h
- formk_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- formt_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- Four_ds()
: emdata_sparx.h
- Four_shuf_ds_cen_us()
: emdata_sparx.h
- fouriergridrot2d()
: emdata_sparx.h
- fouriergridrot_shift2d()
: emdata_sparx.h
- fourierproduct()
: fundamentals.cpp
- FourInterpol()
: emdata_sparx.h
- FourTruncate()
: emdata_sparx.h
- free_matrix()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- free_memory()
: emdata_core.h
- free_rdata()
: emdata_core.h
- free_vector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- freev_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- frm_2d_Align()
: aligner.cpp
- Frngs()
: util_sparx.h
- frngs()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- Frngs_inv()
: util_sparx.h
- fsc_tomo_cmp_cuda()
: cuda_cmp.h
- fwdpj3()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, project3d.h, project3d.cpp
- fwdpj3_Cart()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, utilcomm_Cart.h, project3d_Cart.h, project3d_Cart.cpp
- gcv_tsvd()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- GCVfun_Tik()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- GCVmin_Tik()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- gcvstopfun()
: HyBR_Cart.h, HyBR_Cart.cpp
- generate_noise()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- generatesubmax()
: util_sparx.h
- get_2dcview()
: emdata_metadata.h
- get_2dview()
: emdata_metadata.h
- get_3dcview()
: emdata_metadata.h
- get_3dcviewptr()
: emdata_metadata.h
- get_3dview()
: emdata_metadata.h
- get_amplitude_thres()
: emdata_metadata.h
- get_array_offsets()
: emdata_core.h
- get_attr()
: emdata_metadata.h
- get_attr_default()
: emdata_metadata.h
- get_attr_dict()
: emdata_metadata.h
- get_biggest_cluster()
: util_sparx.h
- get_changecount()
: emdata_metadata.h
- get_circle_mean()
: emdata_metadata.h
- get_col()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h, emdata_core.h
- get_complex_at()
: emdata_core.h
- get_complex_index()
: emdata_core.h
- get_complex_index_fast()
: emdata_core.h
- get_const_data()
: emdata_metadata.h
- get_ctf()
: emdata_metadata.h
- get_cuda_array()
: cuda_util.h
- get_data()
: emdata_metadata.h
- get_data_as_vector()
: emdata_metadata.h
- get_data_pickle()
: emdata_metadata.h
- get_edge_mean()
: emdata_metadata.h
- get_edgemean_cuda()
: cuda_util.h
- get_fft_amplitude()
: emdata_metadata.h
- get_fft_amplitude2D()
: emdata_metadata.h
- get_fft_phase()
: emdata_metadata.h
- get_flags()
: emdata_metadata.h
- get_ndim()
: emdata_metadata.h
- get_path()
: emdata_metadata.h
- get_pathnum()
: emdata_metadata.h
- get_pixel_conv()
: emdata_sparx.h
- get_pixel_conv7()
: emdata_sparx.h
- get_pixel_conv_new()
: util_sparx.h
- get_pixel_conv_new_background()
: util_sparx.h
- get_pixel_filtered()
: emdata_sparx.h
- get_pow()
: emdata_sparx.h
- get_rank()
: emfft.cpp
- get_row()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h, emdata_core.h
- get_size()
: emdata_metadata.h
- get_slice()
: util_sparx.h
- get_stats_cuda()
: cuda_cmp.h
- get_supp_pickle()
: emdata_metadata.h
- get_transform()
: emdata_metadata.h
- get_transform_params()
: util_sparx.h
- get_translation()
: emdata_metadata.h
- get_value_at()
: emdata_core.h
- get_value_at_index()
: emdata_core.h
- get_value_at_wrap()
: emdata_core.h
- get_value_at_wrap_cuda()
: cuda_cmp.h
- get_xoff()
: emdata_metadata.h
- get_xsize()
: emdata_metadata.h
- get_yoff()
: emdata_metadata.h
- get_ysize()
: emdata_metadata.h
- get_zoff()
: emdata_metadata.h
- get_zsize()
: emdata_metadata.h
- getcb2sph()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, utilcomm_Cart.h, project3d_Cart.h, project3d_Cart.cpp
- getconvpt2d_kbi0()
: emdata_sparx.h
- getCudaDeviceAuto()
: cuda_util.h
- getCudaDeviceManually()
: cuda_util.h
- getnnz()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, project3d.h, project3d.cpp
- getnp_()
: util_sparx.cpp
- getptype()
: mympimodule.c
- getvec()
: util_sparx.h
- greaterthan()
: emdata_metadata.cpp
- group_processors()
: processor.h
- group_proj_by_phitheta()
: util_sparx.h
- mad_scalar()
: util_sparx.h
- madn_scalar()
: util_sparx.h
- main()
: speedtest.cpp, proc2d.cpp, iminfo.cpp, baldwinweights.cpp, tests.cpp, testc.cpp, doapmq.cpp, doapmd.cpp, runcartrec.cpp, rununified.cpp, runsirt_Cart.cpp, runsirt.cpp, runhybrid.cpp, runali3d_d.cpp
- mainlb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- make_proj_mat()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, project3d.h, project3d.cpp
- make_ref1()
: ali3d_unified_mpi.cpp
- mask_contig_region()
: emdata_metadata.h
- matrix()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- matupd_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- matvec_mult()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- matvec_multT()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- max2d()
: reconstructor.cpp
- max3d()
: reconstructor.cpp
- max_int()
: ctf.cpp
- mcf_cuda()
: cuda_processor.h
- mean()
: util_sparx.h
- median()
: rsconvolution.cpp
- merge_peaks()
: util_sparx.h
- min_dist_four()
: util_sparx.h
- min_dist_real()
: util_sparx.h
- min_int()
: ctf.cpp
- mono()
: util_sparx.h
- move_points()
: util_sparx.h
- mpi_alltoall()
: mympimodule.c
- mpi_alltoallv()
: mympimodule.c
- mpi_attr_get()
: mympimodule.c
- mpi_barrier()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_bcast()
: mympimodule.c
- mpi_bcast_recv()
: mpi_eman.c
- mpi_bcast_send()
: mpi_eman.c
- mpi_comm_create()
: mympimodule.c
- mpi_comm_dup()
: mympimodule.c
- mpi_comm_group()
: mympimodule.c
- mpi_comm_rank()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_comm_set_errhandler()
: mympimodule.c
- mpi_comm_size()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_comm_split()
: mympimodule.c
- mpi_error()
: mympimodule.c
- mpi_finalize()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_gather()
: mympimodule.c
- mpi_gatherv()
: mympimodule.c
- mpi_get_count()
: mympimodule.c
- mpi_get_processor_name()
: mympimodule.c
- mpi_group_incl()
: mympimodule.c
- mpi_group_rank()
: mympimodule.c
- mpi_init()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_iprobe()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_irecv()
: mympimodule.c
- mpi_isend()
: mympimodule.c
- mpi_probe()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_recv()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_reduce()
: mympimodule.c
- mpi_scatter()
: mympimodule.c
- mpi_scatterv()
: mympimodule.c
- mpi_send()
: mympimodule.c, mpi_eman.c
- mpi_start()
: mympimodule.c
- mpi_status()
: mympimodule.c
- mpi_test()
: mympimodule.c
- mpi_wait()
: mympimodule.c
- mpi_wtick()
: mympimodule.c
- mpi_wtime()
: mympimodule.c
- mul_img()
: util_sparx.h
- mul_scalar()
: util_sparx.h
- muln_img()
: util_sparx.h
- mult()
: emdata_core.h
- mult_circ()
: rsconvolution.cpp
- mult_complex_efficient()
: emdata_core.h
- mult_complex_efficient_cuda()
: cuda_processor.h
- mult_internal()
: rsconvolution.cpp
- mult_radial()
: emdata_sparx.h
- mult_scalar()
: util_sparx.h
- multi_align_error()
: util_sparx.h
- multi_align_error_dfunc()
: util_sparx.h
- multi_align_error_func()
: util_sparx.h
- multi_align_error_func2()
: util_sparx.h
- multi_processors()
: processor.h
- multiref_peaks_ali2d()
: util_sparx.h
- multiref_peaks_compress_ali2d()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d_delta()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d_local()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d_local_psi()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d_nom()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_2d_peaklist()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_helical()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_helical_90()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_helical_90_local()
: util_sparx.h
- multiref_polar_ali_helical_local()
: util_sparx.h
- myerror()
: mympimodule.c
- mytimer()
: doapmq.cpp, doapmd.cpp
- myvector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- onelinenn()
: emdata_sparx.h
- onelinenn_ctf()
: emdata_sparx.h
- onelinenn_ctf_applied()
: emdata_sparx.h
- onelinenn_mult()
: emdata_sparx.h
- operator *()
: vecmath.h, vec3.h, transform.h, quaternion.h, emdata.h
- operator *=()
: emdata_core.h
- operator!=()
: vec3.h, quaternion.h, geometry.h, emobject.h
- operator()()
: emdata_core.h
- operator+()
: vec3.h, quaternion.h, emdata.h
- operator+=()
: emdata_core.h
- operator-()
: vec3.h, quaternion.h, geometry.h, emdata.h
- operator-=()
: emdata_core.h
- operator/()
: vec3.h, quaternion.h, emdata.h
- operator/=()
: emdata_core.h
- operator<()
: geometry.h
- operator<<()
: vecmath.h, emdata_sparx.cpp
- operator==()
: vec3.h, quaternion.h, geometry.h, emobject.h, emdata_core.h
- optim_()
: util_sparx.cpp
- pack_complex_to_real()
: util_sparx.h
- pad()
: util_sparx.h
- pad_corner()
: emdata_sparx.h
- padfft_slice()
: reconstructor.h
- parabld()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- ParseAlignOptions()
: utilparse.h, utilparse.cpp, utilcomm.h
- peak_ccf()
: emdata_sparx.h
- peak_search()
: emdata_sparx.h
- peakcmp()
: emdata_sparx.h
- periodogram()
: fundamentals.cpp
- phase()
: emdata_core.h
- phase_cog()
: emdata_sparx.h
- Polar2D()
: util_sparx.h
- Polar2Dm()
: util_sparx.h
- Polar2Dmi()
: util_sparx.h
- portable_fseek()
: portable_fileio.h
- portable_ftell()
: portable_fileio.h
- pow_ii()
: lapackblas.cpp
- pow_ri()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- power()
: emdata_core.h
- prb1d()
: spidutil.h, spidutil.cpp, util_sparx.h
- predict()
: util_sparx.h
- print_image()
: emdata_io.h
- print_matrix()
: transform.cpp, utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- print_vector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- printImage()
: reconstructor.cpp
- printmatrix()
: util.cpp
- printvector()
: util.cpp
- prn1lb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- prn2lb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- prn3lb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- process()
: emdata_modular.h
- process_inplace()
: emdata_modular.h
- projct_()
: util_sparx.cpp
- project()
: emdata_modular.h
- projgr_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- put_col()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- pw_extract()
: util_sparx.h
- r_sign()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- Radialize()
: util_sparx.h
- random_()
: util_sparx.cpp
- random_seed()
: randnum.cpp
- rdiv()
: emdata.h
- read_binedimage()
: emdata_io.h
- read_data()
: emdata_metadata.h
- read_image()
: emdata_io.h
- read_images()
: emdata_io.h
- read_images_ext()
: emdata_io.h
- read_int_and_space()
: pgmio.cpp
- ReadAngTrandDist()
: utilcomm.h, utilcomm.cpp
- ReadAngTrandDist_Cart()
: utilcomm_Cart.h, utilcomm_Cart.cpp
- ReadStackandDist()
: utilcomm.h, utilcomm.cpp
- ReadStackandDist_Cart()
: utilcomm_Cart.h, utilcomm_Cart.cpp
- ReadVandBcast()
: utilcomm.h, utilcomm.cpp
- real()
: emdata_core.h, lapackblas.h
- real2complex()
: emdata_core.h
- real2FH()
: emdata_sparx.h
- recons3d_4nn()
: ali3d_d_mpi.h, ali3d_d_mpi.cpp
- recons3d_CGLS_mpi_Cart()
: HyBR_Cart.h, HyBR_Cart.cpp
- recons3d_HyBR_mpi_Cart()
: HyBR_Cart.h, HyBR_Cart.cpp
- recons3d_sirt_mpi()
: sirt.h, sirt.cpp
- recons3d_sirt_mpi_Cart()
: sirt_Cart.h, sirt_Cart.cpp
- reconstitute_image_mask()
: util_sparx.h
- refalidf()
: aligner.cpp
- refalifdf()
: aligner.cpp
- refalifn()
: aligner.cpp
- refalifn3dquat()
: aligner.cpp
- refalifnfast()
: aligner.cpp
- refalin3d_perturbquat()
: aligner.cpp
- render_amp24()
: emdata_transform.h
- render_amp8()
: emdata_transform.h
- render_ap24()
: emdata_transform.h
- replace_amplitudes()
: emdata_sparx.h
- restrict1()
: util_sparx.h, emdata_sparx.h
- restrict2()
: emdata_sparx.h
- ri2ap()
: emdata_transform.h
- ri2inten()
: emdata_transform.h
- ringwe()
: spidutil.h, spidutil.cpp, ali3d_d_mpi.h, ali3d_d_mpi.cpp
- rot_filt_sum()
: cuda_ccf.h
- rot_scale_conv()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_conv7()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_conv_new()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_conv_new_3D()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_conv_new_background()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_conv_new_background_3D()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_trans()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_trans2D()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_trans2D_background()
: emdata_sparx.h
- rot_scale_trans_background()
: emdata_sparx.h
- rotavg()
: emdata_sparx.h
- rotavg_i()
: emdata_sparx.h
- row_sum()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- rsconvolution()
: fundamentals.h
- rscp()
: fundamentals.h
- rsub()
: emdata.h
- s_cat()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- s_cmp()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp, lapackblas.h, lapackblas.cpp
- s_copy()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp, lapackblas.h, lapackblas.cpp
- samestr()
: vtkio.cpp
- sanitycheck()
: util_sparx.h
- saxpy_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sbdsqr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- scale_pixel()
: emdata_metadata.h
- scoord_()
: util_sparx.cpp
- scopy_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sdot_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- search2()
: util_sparx.h
- select_kth_smallest()
: rsconvolution.cpp
- self_correlation()
: fundamentals.h
- set_array_offsets()
: emdata_core.h
- set_attr()
: emdata_metadata.h
- set_attr_dict()
: emdata_metadata.h
- set_attr_dict_explicit()
: emdata_metadata.h
- set_attr_python()
: emdata_metadata.h
- set_changecount()
: emdata_metadata.h
- set_col()
: emdata_core.h
- set_complex()
: emdata_metadata.h
- set_complex_at()
: emdata_core.h
- set_complex_size()
: emdata_metadata.h
- set_complex_x()
: emdata_metadata.h
- set_ctf()
: emdata_metadata.h
- set_data()
: emdata_metadata.h
- set_data_pickle()
: emdata_metadata.h
- set_fftodd()
: emdata_metadata.h
- set_fftpad()
: emdata_metadata.h
- set_FH()
: emdata_metadata.h
- set_flags()
: emdata_metadata.h
- set_flipped()
: emdata_metadata.h
- set_line()
: util_sparx.h
- set_nxc()
: emdata_metadata.h
- set_path()
: emdata_metadata.h
- set_pathnum()
: emdata_metadata.h
- set_ri()
: emdata_metadata.h
- set_rotation()
: emdata_metadata.h
- set_row()
: emdata_core.h
- set_shuffled()
: emdata_metadata.h
- set_size()
: emdata_metadata.h
- set_supp_pickle()
: emdata_metadata.h
- set_translation()
: emdata_metadata.h
- set_value_at()
: emdata_core.h
- set_value_at_fast()
: emdata_core.h
- set_value_at_index()
: emdata_core.h
- set_xyzoff()
: emdata_metadata.h
- setnring()
: spidutil.h, spidutil.cpp
- setpart()
: utilcomm.h, utilcomm.cpp
- setpart_gc1()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, utilcomm_Cart.h, utilcomm_Cart.cpp
- setpart_gr1()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, utilcomm_Cart.h, utilcomm_Cart.cpp
- setulb_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- sgebd2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgebrd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgelq2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgelqf_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgemm_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgemv_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgeqr2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgeqrf_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sger_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sgesvd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sget_value_at()
: emdata_core.h
- sget_value_at_interp()
: emdata_core.h
- shuffle_pad_corner()
: emdata_sparx.h
- slabrd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slacpy_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slae2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed0_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed1_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed3_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed4_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed5_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed6_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed7_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed8_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaed9_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaeda_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaev2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slamc1_()
: lapackblas.cpp
- slamc2_()
: lapackblas.cpp
- slamc3_()
: lapackblas.cpp
- slamc4_()
: lapackblas.cpp
- slamc5_()
: lapackblas.cpp
- slamch_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slamrg_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slange_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slanst_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slansy_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slapy2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slarf_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slarfb_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slarfg_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slarft_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slartg_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slas2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slascl_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slaset_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq1_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq3_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq4_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq5_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasq6_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasrt_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slassq_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slasv2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slatrd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- slicereverse()
: util_sparx.h
- snrm2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorg2l_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorg2r_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorgbr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorgl2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorglq_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorgql_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorgqr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorgtr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorm2r_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sormbr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sorml2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sormlq_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sormqr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sph2cb()
: project3d.h, project3d.cpp
- sphpart()
: utilcomm2d.cpp, runcartrec.cpp, utilcomm_Cart.h, project3d_Cart.h, project3d_Cart.cpp
- spline()
: util_sparx.h
- spline_mat()
: util_sparx.h
- splint()
: util_sparx.h
- sqrt()
: emdata_core.h
- srot_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sscal_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sstedc_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssteqr_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssterf_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sstevd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sswap_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssyev_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssymv_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssyr2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssyr2k_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssytd2_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- ssytrd_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- standard_project()
: cuda_projector.h
- Steepda()
: steepest.h, steepest.cpp
- Steepda_G()
: steepest.h, steepest.cpp
- store_()
: util_sparx.cpp
- strmm_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- strmv_()
: lapackblas.h, lapackblas.cpp
- sub()
: emdata_core.h
- sub_fav()
: util_sparx.h
- sub_img()
: util_sparx.h
- submatrix()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- subn_img()
: util_sparx.h
- subsm_()
: lbfgsb.h, lbfgsb.cpp
- subsquare()
: emdata_core.h
- subtract_cuda()
: cuda_processor.h
- subvector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- sum_vector()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- svd()
: utilnum.h, utilnum.cpp, hybr.h
- swap_()
: util_sparx.cpp
- swapx()
: emdata_sparx.cpp
- swptst_()
: util_sparx.cpp
- symplane0()
: emdata_sparx.h
- symplane0_ctf()
: emdata_sparx.h
- symplane0_rect()
: emdata_sparx.h
- symplane1()
: emdata_sparx.h
- symplane2()
: emdata_sparx.h
- symquat()
: aligner.cpp
- symvol()
: emdata_sparx.h
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