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Class Members
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File Members
All
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Functions
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Variables
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Typedefs
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Enumerations
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Enumeration values
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Defines
_
|
a
|
b
|
c
|
d
|
e
|
f
|
g
|
h
|
i
|
k
|
l
|
m
|
n
|
o
|
p
|
q
|
r
|
s
|
t
|
u
|
v
|
w
|
x
|
y
|
z
- _ -
__func__ :
log.h
- a -
a_ref :
lapackblas.cpp
abs :
util_sparx.cpp
,
lapackblas.h
abs_ :
lbfgsb.cpp
AMAX1 :
util_sparx.cpp
AMIN1 :
util_sparx.cpp
angexps :
spidutil.h
anglelist :
projector.cpp
angles :
runcartrec.cpp
,
spidutil.h
angrefs :
spidutil.h
ARG_ARRAY :
mympimodule.c
Assert :
emassert.h
assign :
util_sparx.cpp
Av :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
avagadro :
emdata_sparx.cpp
- b -
b :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
b_ref :
lapackblas.cpp
BadAllocException :
exception.h
bfc :
spidutil.h
bi :
spidutil.h
,
spidfft.h
,
util_sparx.cpp
br :
spidutil.h
,
spidfft.h
,
util_sparx.cpp
- c -
C :
emdata_sparx.cpp
c___ref :
lapackblas.cpp
CAST :
mympimodule.c
CC :
util_sparx.cpp
cent :
util_sparx.cpp
circ :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
circ1 :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
circ1b :
util_sparx.cpp
circ2 :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
circ2b :
util_sparx.cpp
CLK_TCK :
doapmq.cpp
,
doapmd.cpp
COL :
sirt_Cart.cpp
,
runsirt_Cart.cpp
com_ray_size :
mympimodule.c
COM_TYPE :
mympimodule.c
COPYWRITE :
mympimodule.c
cord :
utilcomm2d.cpp
,
project3d_Cart.cpp
,
project3d.cpp
,
projector.cpp
covmat :
analyzer.cpp
CP :
util_sparx.cpp
CPS :
speedtest.cpp
CU_SAFE_CALL :
cuda_defs.h
CU_SAFE_CALL_NO_SYNC :
cuda_defs.h
cube :
project3d.cpp
,
projector.cpp
cuda_cmp_h__ :
cuda_cmp.h
cuda_mpi_kmeans_h__ :
cuda_mpi_kmeans.h
cuda_processor_h__ :
cuda_processor.h
cuda_project_h__ :
cuda_projector.h
cuda_reconstruct_h__ :
cuda_reconstructor.h
CUDA_SAFE_CALL :
cuda_defs.h
CUDA_SAFE_CALL_NO_SYNC :
cuda_defs.h
CUFFT_SAFE_CALL :
cuda_defs.h
CUT_BANK_CHECKER :
cuda_defs.h
CUT_CHECK_ERROR :
cuda_defs.h
CUT_CHECK_ERROR_GL :
cuda_defs.h
CUT_CONDITION :
cuda_defs.h
CUT_DEVICE_INIT :
cuda_defs.h
CUT_DEVICE_INIT_DRV :
cuda_defs.h
CUT_EXIT :
cuda_defs.h
CUT_SAFE_CALL :
cuda_defs.h
CUT_SAFE_MALLOC :
cuda_defs.h
CUTIL_API :
cuda_defs.h
- d -
dabs :
lapackblas.h
data :
util_sparx.cpp
DATA_TYPE :
mympimodule.c
DEFINE_IMAGEIO_FUNC :
imageio.h
deg_rad :
util_sparx.cpp
deg_to_rad :
util_sparx.cpp
density_protein :
emdata_sparx.cpp
df2cmax :
lapackblas.h
df2cmin :
lapackblas.h
DGR_TO_RAD :
util_sparx.cpp
,
emdata_sparx.cpp
dgr_to_rad :
emconstants.h
,
util_sparx.cpp
diag :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
dlist :
spidutil.h
DLL_MAPPING :
cuda_defs.h
DM :
util_sparx.cpp
dm :
utilcomm2d.cpp
,
project3d_Cart.cpp
,
project3d.cpp
,
projector.cpp
dout :
util_sparx.cpp
dt :
fgcalc.cpp
- e -
eigval :
analyzer.cpp
eigvec :
analyzer.cpp
EMAN2_ALIGNER_DEBUG :
aligner.cpp
eman__aligner_h__ :
aligner.h
eman__amiraio_h__ :
amiraio.h
eman__byteorder_h__ :
byteorder.h
eman__ctf__h__ :
ctf.h
eman__cuda_emfft_h__ :
cuda_emfft.h
eman__cuda_util_h__ :
cuda_util.h
eman__emcache__h__ :
emcache.h
eman__emdata_h__ :
emdata.h
eman__emdatacuda_h__ :
emdata_cuda.h
eman__emimio_h__ :
emimio.h
eman__emio_h__ :
emio.h
eman__emutil__h__ :
emutil.h
eman__exception_h__ :
exception.h
eman__fitsio_h__ :
fitsio.h
eman__gatan2io_h__ :
gatan2io.h
eman__hdf_filecache__h__ :
hdf_filecache.h
eman__hdfio2_h__ :
hdfio2.h
eman__hdfio_h__ :
hdfio.h
eman__icosio_h__ :
icosio.h
eman__imageio_h__ :
imageio.h
eman__imagicio2_h__ :
imagicio2.h
eman__imagicio_h__ :
imagicio.h
eman__ioioio_h__ :
all_imageio.h
eman__jpegio_h__ :
jpegio.h
eman__log__h__ :
log.h
eman__lstio_h__ :
lstio.h
eman__lstiofast_h__ :
lstfastio.h
eman__mrcio_h__ :
mrcio.h
eman__object__h__ :
emobject.h
eman__omapio_h__ :
omapio.h
eman__pgmio_h__ :
pgmio.h
eman__pifio_h__ :
pifio.h
eman__pngio_h__ :
pngio.h
eman__projector_h__ :
projector.h
eman__quaternion_h__ :
quaternion.h
eman__salio_h__ :
salio.h
eman__serio_h__ :
serio.h
eman__single_spider_io_h__ :
sspiderio.h
eman__situsio_h__ :
situsio.h
eman__spiderio_h__ :
spiderio.h
eman__symmetry_h__ :
symmetry.h
eman__tiffio_h__ :
tifio.h
eman__transform_h__ :
transform.h
eman__util_h__ :
util.h
eman__v4l2_h__ :
v4l2io.h
eman__vec3_h__ :
vec3.h
eman__vtkio_h__ :
vtkio.h
eman__xplorio_h__ :
xplorio.h
eman__xydata_h__ :
xydata.h
eman__xyzio_h__1 :
io_template.h
eman_aligner_template_h__ :
aligner_template.h
eman_averager_h__ :
averager.h
eman_averager_template_h__ :
averager_template.h
eman_boxingtools_h__ :
boxingtools.h
eman_cmp__h__ :
cmp.h
eman_cmp_template_h__ :
cmp_template.h
eman_processor_h__ :
processor.h
eman_processor_sparx_h__ :
processor_sparx.h
eman_processor_template_h__ :
processor_template.h
eman_projector_template_h__ :
projector_template.h
eman_reconstructor_h__ :
reconstructor.h
eman_reconstructor_template_h__ :
reconstructor_template.h
eman_reconstructor_tools_h__ :
reconstructor_tools.h
EMDATA_EMAN2_DEBUG :
emdata.cpp
EmptyContainerException :
exception.h
ENTERFUNC :
log.h
EXITFUNC :
log.h
expdir :
spidutil.h
expdirs :
spidutil.h
- f -
f2cmax :
lapackblas.h
f2cmin :
lapackblas.h
FALSE :
util_sparx.cpp
FALSE_ :
util_sparx.cpp
,
lbfgsb.cpp
,
lapackblas.h
fangles :
spidutil.h
fdata :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
FFTRADIALOVERSAMPLE :
processor.cpp
FileAccessException :
exception.h
fint :
emdata_sparx.cpp
fit :
spidutil.h
fitp :
spidutil.h
fout :
emdata_sparx.cpp
frand :
utilnum.h
,
HyBR_Cart.h
,
hybr.h
- g -
givcol_ref :
lapackblas.cpp
givnum_ref :
lapackblas.cpp
grad :
ali3d_unified_mpi.cpp
gradloc :
fgcalc.cpp
- h -
hvec :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
- i -
ImageDimensionException :
exception.h
ImageFormatException :
exception.h
ImageReadException :
exception.h
images :
runcartrec.cpp
,
projector.cpp
ImageWriteException :
exception.h
img2_ptr :
util_sparx.cpp
img_ptr :
util_sparx.cpp
imgcirc :
spidutil.h
imgdata :
analyzer.cpp
imgfrom :
spidutil.h
imgstk :
spidutil.h
imgto :
spidutil.h
imgwindow :
spidutil.h
in :
emdata_sparx.cpp
inp :
util_sparx.cpp
integer :
lapackblas.h
,
utilnum.h
,
hybr.h
InvalidCallException :
exception.h
InvalidParameterException :
exception.h
InvalidStringException :
exception.h
InvalidValueException :
exception.h
- k -
key :
util_sparx.cpp
- l -
lband :
util_sparx.cpp
lcg :
spidutil.h
LIBRARY :
mympimodule.c
LOGDEBUG :
log.h
LOGERR :
log.h
LOGVAR :
log.h
LOGWARN :
log.h
- m -
MACHEPS :
steepest.cpp
MARCHING_CUBES_DEBUG :
marchingcubes.h
max :
spidutil.h
,
utilnum.h
,
hybr.h
max_ :
lbfgsb.cpp
MAX_ERODE :
volume.h
MAX_QUEUELEN :
volume.h
MAX_SHEETS :
volume.h
min :
spidutil.h
,
utilnum.h
,
hybr.h
min0 :
spidutil.h
min_ :
lbfgsb.cpp
MPI_SUBVERSION :
mympimodule.c
MPI_VERSION :
mympimodule.c
MUTEX :
util.h
mymax :
util_sparx.cpp
mymin :
util_sparx.cpp
- n -
new_ptr :
util_sparx.cpp
newangles :
spidutil.h
NotExistingObjectException :
exception.h
NullPointerException :
exception.h
NUMBER :
fgcalc.h
,
ali3d_unified_mpi.h
numr :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
- o -
old_ptr :
util_sparx.cpp
OutofRangeException :
exception.h
outp :
util_sparx.cpp
- p -
phi :
util_sparx.cpp
PI :
sirt_Cart.h
,
sirt.h
,
runsirt_Cart.cpp
,
runsirt.cpp
,
HyBR_Cart.h
,
ali3d_unified_mpi.h
,
ali3d_d_mpi.h
PI2 :
util_sparx.cpp
pnewimg :
emdata_sparx.cpp
proj :
emdata_sparx.cpp
PROJ :
util_sparx.cpp
ptrs :
utilcomm2d.cpp
,
project3d_Cart.cpp
,
project3d.cpp
,
projector.cpp
PyMODINIT_FUNC :
mympimodule.c
- q -
q :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
q2_ref :
lapackblas.cpp
q_ref :
lapackblas.cpp
qmat :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
qstore_ref :
lapackblas.cpp
QUADPI :
util_sparx.cpp
,
emdata_sparx.cpp
quadpi :
util_sparx.cpp
- r -
R :
emdata_sparx.cpp
rad_deg :
util_sparx.cpp
rad_to_deg :
util_sparx.cpp
rad_to_dgr :
emconstants.h
,
util_sparx.cpp
rdata :
emdata_sparx.cpp
,
analyzer.cpp
refcstk :
spidutil.h
refdir :
spidutil.h
refdirs :
spidutil.h
resid :
pca.cpp
rhs :
fgcalc.cpp
RI :
util_sparx.cpp
ROTEPSILON :
varimax.cpp
ROTMAXITER :
varimax.cpp
rotmp :
spidutil.h
ROW :
sirt_Cart.cpp
,
runsirt_Cart.cpp
rvec :
fgcalc.cpp
- s -
s_ref :
lapackblas.cpp
shifts :
spidutil.h
sign :
util_sparx.cpp
sparx_cuda_kmeans_h__ :
cuda_kmeans.h
sphere :
project3d.cpp
,
projector.cpp
sqimg :
spidutil.h
square :
emdata_sparx.cpp
SS :
util_sparx.cpp
stack_ref :
lapackblas.cpp
subdiag :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
SVD_CLASSIFIER_DEBUG :
boxingtools.cpp
SWAP :
rsconvolution.cpp
- t -
t :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
t7 :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
t_ref :
lapackblas.cpp
tab1 :
spidutil.h
,
spidfft.h
,
util_sparx.cpp
theta :
util_sparx.cpp
thetast :
util_sparx.cpp
tmt :
spidutil.h
TOL :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
tot :
spidutil.h
totmin :
spidutil.h
totmir :
spidutil.h
TRUE :
util_sparx.cpp
TRUE_ :
util_sparx.cpp
,
lbfgsb.cpp
,
lapackblas.h
ts :
util_sparx.cpp
tw :
reconstructor.cpp
TypeException :
exception.h
- u -
u_ref :
lapackblas.cpp
UnexpectedBehaviorException :
exception.h
- v -
V :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
v :
pca.cpp
v0 :
pca.cpp
,
analyzer.cpp
v_ref :
lapackblas.cpp
VERSION :
mympimodule.c
VERT_FUNC :
mympimodule.c
VP :
util_sparx.cpp
vt_ref :
lapackblas.cpp
VV :
util_sparx.cpp
- w -
W :
util_sparx.cpp
w_ref :
lapackblas.cpp
weight :
util_sparx.cpp
work_ref :
lapackblas.cpp
wr :
spidutil.h
- x -
X :
emdata_sparx.cpp
x :
utilcomm2d.cpp
,
project3d_Cart.cpp
,
project3d.cpp
,
projector.cpp
x_ref :
lapackblas.cpp
xcmplx :
spidutil.h
,
spidfft.h
,
util_sparx.cpp
xim :
spidutil.h
,
util_sparx.cpp
- y -
y :
utilcomm2d.cpp
,
project3d_Cart.cpp
,
project3d.cpp
,
projector.cpp
Y :
emdata_sparx.cpp
y_ref :
lapackblas.cpp
- z -
Z :
emdata_sparx.cpp
z33 :
spidutil.h
z___ref :
lapackblas.cpp
Generated on Tue Jun 11 13:49:56 2013 for EMAN2 by
1.3.9.1